Vários núcleos apresentavam contorno muito irregular. Dobras e reentrâncias da membrana nuclear (carioteca) por vezes pareciam segregar parcelas de cromatina. Estas ficavam presas à porção principal do núcleo pelos folhetos da carioteca em íntimo contato,  lembrando cordão umbilical, ou um meso, como o mesocólon. 

Ao lado, exemplo extremo de dobras da membrana nuclear.  Célula contém também corpos apoptóticos englobados no citoplasma. 

O complexo de Golgi era proeminente em várias células neoplásicas, em forma de cisternas empilhadas como panquecas, e vesículas associadas às bordas.  O Golgi está envolvido no processamento e destino das proteínas produzidas pela célula. 

Os lisossomos aparecem como estruturas arredondadas e eletrodensas, responsáveis pela degradação controlada de  macromoléculas intracelulares. 

São constituídos por subunidades a e b da proteína tubulina arranjadas em um cilindro oco com diâmetro externo de 25 nm.  Cada cilindro é formado por 13 protofilamentos em paralelo. Microtúbulos são estruturas rígidas,  encontradas em prolongamentos neuronais (dendritos e axônios), e sugerem que os perfis celulares aqui observados podem estar associados a células tumorais com diferenciação neuronal. 

Mitocôndrias eram de modo geral normais no espécime. Esta curiosa organela aberrante foi achado isolado em um prolongamento celular.   O diagnóstico de mitocôndria é baseado na dupla membrana externa e cristas. 

O espaço entre os corpos das células neoplásicas é ocupado por finos prolongamentos citoplasmáticos compactamente arranjados, à maneira do neurópilo da substância cinzenta normal do cérebro, como no córtex. 

Os prolongamentos citoplasmáticos são de variados diâmetros. Ajustam-se entre si como peças de um quebra-cabeça, praticamente sem deixar espaço extracelular. A arquitetura interna e composição de organelas é variável, sendo comuns perfis ricos em microtúbulos, coexistindo com mitocôndrias, lisossomos, vesículas e canais do retículo endoplasmático liso.

Os prolongamentos citoplasmáticos por vezes agrupam-se, lembrando as pseudorrosetas de Homer Wright vistas em tumores de linhagem neuronal, como meduloblastomas, neurocitoma central, e neuroblastoma periférico. 

Ocasionalmente, estruturas lembrando neurônios imaturos eram encontradas. Ao lado, um perfil citoplasmático com polaridade. A parte em cima e à direita, mais larga, continua-se por um prolongamento com microtúbulos, análogo ao que se observaria em um dendrito ou axônio. A semelhança é acentuada por junções eletrodensas em ambas extremidades da estrutura - que lembram sinapses, embora sem vesículas de transmissor. 

Neste outro perfil, a semelhança com um neurônio é acentuada por rosetas de ribossomos no citoplasma da extremidade bulbosa, ausentes no prolongamento rico em microtúbulos que se estende à esquerda. 

Não raro, observavam-se junções eletrodensas do tipo adherens entre prolongamentos celulares. A morfologia lembrava sinapses entre terminais axonais e espinhas dendríticas, com a importante diferença que nenhum dos perfis em contato continha vesículas secretoras.  O encontro destas estruturas no neurópilo de um tumor imaturo sugere diferenciação neuronal incipiente. 

Uma figura de mitose, presumivelmente atípica, mostra cromossomos condensados em pequenos grupos irregulares e espalhados pelo citoplasma. A membrana nuclear está ausente, já que se desintegra no início do processo. A célula assume contorno arredondado.  Os centríolos não estão visíveis, ambos fora do plano de corte. 

É constituído por microtúbulos que irradiam a partir dos centrossomos, estes  fora do plano de corte.  Os microtúbulos se inserem nos centrômeros dos cromossomos condensados e os tracionam para os polos da célula na anáfase. 

Figuras de apoptose eram comuns neste tumor, consoante com a rápida proliferação e degradação celulares de um tumor altamente maligno (ver Ki-67). Corpos apoptóticos, com variada morfologia e em diferentes fases, não raro estavam englobados por células vizinhas viáveis, como no exemplo ao lado.