O astrocitoma subependimário de células gigantes aparece como nódulo bem delimitado, aparentemente implantado na cabeça do núcleo caudado esquerdo, projetando-se para o septo pelúcido, que está levemente desviado. Mostra isossinal em T1, hipersinal em T2 e FLAIR  e impregna-se por contraste. A histologia e imunohistoquímica estão em outras páginas.  Os nódulos calcificados têm também localização subependimária na porção principal do ventrículo lateral em ambos lados e são demonstrados na seqüência com gradiente pela ausência de sinal (aparecem em negro). 

Os túberes dos hemisférios cerebrais são evidenciados pela rarefação da substância branca subcortical (medular do giro), que aparece com hipossinal em T1 e hipersinal em T2. Em FLAIR as lesões têm sinal variável, desde hipersinal a ausência de sinal, dependendo da proporção entre água e macromoléculas (se for semelhante ao líquor há supressão completa de sinal, se houver maior proporção de tecido ou macromoléculas, o sinal ficará mais forte).  Não há captação de contraste. No córtex sobre as áreas descritas as alterações são mínimas. 

No cerebelo, há áreas irregulares de hipersinal em T2 e FLAIR, maiores no hemisfério esquerdo, onde também se observa impregnação pelo gadolínio.