A intensidade das alterações diferia nas várias regiões corticais examinadas. A maior foi observada no lobo frontal, que apresentava hipersinal em difusão nas porções mesiais junto ao giro do cíngulo. As lesões recapitulam as já descritas nos núcleos da base e setor CA1 do hipocampo. 

A vacuolização do neurópilo predominava na camada molecular. O caráter mais frouxo da camada granulosa poderia também corresponder a lesão, mas deixa dúvida no diagnóstico diferencial com artefatos de retração. 

Selecionada para demonstrar a encefalopatia espongiforme no tronco cerebral.  Os vacúolos são notados principalmente nos tratos horizontais de substância branca  que conectam os núcleos da base da ponte com o córtex cerebelar via pedúnculo cerebelar médio. Os núcleos da base da ponte propriamente ditos, que contêm os neurônios, são poupados. Notar as fileiras de oligodendrócitos ao longo dos axônios mielínicos.