Na maioria das células estromais observadas, o citoplasma é escasso, contendo  filamentos intermediários (presumivelmente vimentina, pois há positividade para esta na imunohistoquímica). As poucas organelas restringem-se a ribossomos livres, perfis de retículo endoplasmático rugoso e, ocasionalmente, lisossomos. Mitocôndrias são raras. Foi observado um centríolo. 

São extremamente  numerosos no hemangioblastoma, constituídos por camada única de células endoteliais. A espessura das mesmas é muito variável ao longo da circunferência do capilar. Geralmente o núcleo é grande, e o citoplasma a sua volta é mais abundante.  Em outros segmentos, pode mostrar-se finíssimo, e apresentar poros selados por membrana única (diafragma). Vesículas pinocitóticas são raras ou ausentes. Os capilares são revestidos em toda volta por membrana basal e estão separados das células estromais por elementos do tecido conjuntivo, como fibras colágenas e matriz amorfa. A espessura do conjuntivo varia de capilar a capilar. 

Este neutrófilo em trânsito pelo capilar é caracterizado pelo núcleo multilobado, com cromatina predominantemente densa (heterocromatina), refletindo baixo nível de síntese proteica. 

O citoplasma contém grânulos de variada morfologia e eletrodensidade. Os maiores e mais densos assemelham-se a lisossomos e contêm enzimas digestivas, como hidrolases ácidas, e substâncias antibacterianas e digestivas, como a mieloperoxidase.  Após a fagocitose das partículas estranhas, inclusive bactérias, estas são seladas em vacúolos fagocitários, ou fagossomos. A fusão destes com os lisossomos cria os fagolisossomos, onde o material estranho é degradado por ação enzimática e radicais livres de oxigênio. 

A quantidade de material extracelular é muito variável de uma área a outra neste hemangioblastoma.  Há regiões onde é mais abundante, como no campo ao lado, e como já notado no tricrômico de Masson.  O interstício é rico em fibrilas colágenas orientadas em múltiplas direções, sem formar feixes compactos.  Encontram-se dispersas em matriz extracelular amorfa, correspondendo à substância fundamental do tecido conjuntivo e contendo proteoglicanas e glicosaminoglicanas. 

Mastócitos nos tecidos originam-se (pelo menos em parte) de basófilos do sangue. Estes são os menos comuns dos leucócitos, caracterizados por grânulos citoplasmáticos grandes, intensamente basófilos, que contêm as proteoglicanas sulfatadas heparina e condroitin sulfato, além de histamina e leucotrieno 3.  Tanto os basófilos como os mastócitos têm receptores de membrana altamente específicos para o segmento Fc do IgE, produzido em resposta a alérgenos.  Exposição ao alérgeno leva a rápida exocitose dos grânulos, liberando histamina e outros mediadores vasoativos, que resulta na reação de hipersensibilidade imediata, ou anafilactóide.  Exemplos são a rinite alérgica (febre do feno), asma, urticária e o choque anafilático. 

Os mastócitos eram pouco comuns neste hemangioblastoma e só o demonstrado ao lado foi encontrado em microscopia eletrônica. Para mais exemplos, ver tricrômico de Masson.