A superfície posterior do cisto ósseo aneurismático aflorava na musculatura da nuca. Estes fragmentos mostram fibras musculares esqueléticas na porção inferior das fotos. As fibras estão normais, ou mostram necrose aguda pelo trauma cirúrgico.  Na parte de cima, os septos fibrosos, com neoformação óssea, delimitam cistos de conteúdo sanguíneo. 

A manipulação cirúrgica pode levar à ruptura da membrana externa das fibras musculares (sarcolema), com entrada abrupta e abundante de cálcio na célula. Isto causa o telescopamento das miofibrilas, formando as chamadas bandas de hipercontração (densas e róseas), alternadas por faixas claras ou vazias (onde as miofibrilas se romperam e desgarraram).  O resultado é a necrose da fibra.  As fibras hipercontraídas indicam lesão traumática aguda do músculo. 

O maior volume do cisto ósseo aneurismático é constituído por sangue represado em cistos delimitados por septos fibrosos.  Este sangue extravasa dos capilares dos septos, cuja vascularização é muito abundante.  Quando o paciente fica em repouso, os elementos figurados do sangue decantam, dando os níveis líquidos observados em ressonância magnética, especialmente em imagens pesadas em T2. 

O tecido conjuntivo dos septos que delimitam os cistos hemáticos tem textura e celularidade variáveis.  É composto de tecido fibroso frouxo com numerosos capilares, células inflamatórias, células gigantes multinucleadas e hemácias extravasadas, imitando tecido de granulação jovem. 

Os septos membranosos que delimitam os cistos hemáticos revelam importantes diferenças de celularidade e constituição citológica em áreas vizinhas.  Na foto ao lado, áreas densamente celulares formam ilhotas em meio ao tecido fibroso frouxo e menos celular.