Nos microabscessos há duas áreas distintas: uma região central densa e fortemente basófila (roxa), que é constituída por uma colônia de bactérias. Em volta há um halo espesso de células inflamatórias, basicamente neutrófilos. O conjunto constitui o microabscesso. 

O fato de que há bactérias visíveis é evidência de que a reação inflamatória não foi suficiente para conter a proliferação das mesmas. Isto pode ser por depressão das defesas ou porque a virulência dos germes ou o tamanho do inóculo são muito grandes. 

A necrose liqüefativa é vista em fibras do miocárdio vizinhas aos microabscessos. As fibras necróticas aparecem como material eosinófilo anucleado e são relativamente escassas, pois as enzimas proteolíticas logo as digerem.